普通高中上本科难的原因是多方面的，主要包括以下几点：

基础知识薄弱

普高学生在中考中表现较好，但进入高中后，他们的基础知识可能仍然薄弱，难以适应高中的学习节奏和难度。

教育资源不足

一些普通高中所在地区的教育资源相对较少，师资力量不强，教学设施不完善，导致学生在高中阶段的学习条件较差，从而增加了升本科的难度。

学生基础薄弱

部分学生在初中阶段的学习基础较差，无法适应高中学习的要求，导致学习成绩不理想，影响了升本科的机会。

学科选择不当

有些学生在高中阶段选择了与自己兴趣不符或自身能力不够的学科，导致学习热情不高，学习成绩不佳，进而影响了升本科的准备和机会。

竞争压力大

普通高中升本科的竞争压力较大，尤其是一些优质高校的升学率普遍较低，需要学生具备较高的学习成绩和综合素质才能有机会被录取。

教学策略问题

一些学校的教学策略未能有效适应不同学生的学习需求和方式，导致部分学生无法跟上教学进度，影响学习效果。

学习习惯不良

部分学生存在不良的学习习惯，如抽烟、打游戏、上课不听讲等，这些习惯会极大地影响学习效果，使学生在学习上逐渐落后。

学习环境不佳

普通中学的学习环境相对于重点高中来说存在一些不足之处，学生的基础和能力较弱，学习方式不够好，导致学习成绩始终在及格线附近徘徊。

综上所述，普通高中上本科难是一个复杂的问题，涉及学生个人、家庭、学校和社会等多个方面。要改善这一现状，需要从提高教学质量、优化教学策略、改善学习环境和提供更多的学习支持等多个角度入手。