南京大学取消自考的原因主要基于以下几点：

政策调整：

根据国务院学位委员会《学士学位授权与授予管理办法》（学位【2019】20号）的规定，从2022年开始，普通高等学校授予高等学历继续教育本科学位的专业应当是本单位已获得学士学位授权并正在开展全日制本科生培养的专业。由于南京大学主考的人力资源管理、公共关系两个专业不是其全日制本科的办学专业，因此决定退出自学考试主考。

双一流建设：

南京大学正着力推进“双一流”建设，需要集中优势力量，聚焦内涵式发展。因此，学校决定退出自学考试主考，以更好地分配资源和精力。

专业调整：

南京大学已明确将在2022年底退出自考，涉及的专业包括人力资源管理、公共关系、行政管理学、法律、广告学、工商管理。这些专业在2021年上半年完成最后一批毕业工作，在2021年下半年完成最后一批学位授予工作。

社会认可度：

有观点认为，自考证书的含金量逐年下滑，渐渐得不到社会的认可，因此取消自考也是正常的。

过渡安排：

尽管南京大学退出了自考主考，但已经报考和想报考相关专业的考生仍有机会在过渡期内正常报名参加考试、办理毕业、申请学位。过渡期结束后，除公共关系专业停考外，其他专业将安排新的主考学校，考生可继续报考。

综上所述，南京大学取消自考是基于政策调整、学校发展重点和社会认可度等多方面因素的综合考量。