北京协和医学院和北京大学医学部都是中国顶尖的医学教育机构，各有其专业优势。以下是它们在不同专业的比较：

基础医学

北京协和医学院和北京大学医学部的基础医学专业都非常强，两所学校在这方面的水平相当。

临床医学

北京协和医学院的临床医学专业被广泛认为是非常优秀的，且其临床教学基地和科研平台世界一流。

北京大学医学部的临床医学专业也非常强，尤其是其本硕博连读的八年制项目。

护理学

北京协和医学院的护理学专业是国家特色专业和国家一流专业，具有很高的声誉。

口腔医学

北京大学医学部的口腔医学专业是其王牌专业之一，拥有很高的教学水平和研究实力。

药学

北京协和医学院在药学方面也有很好的表现，尤其是其药理学专业。

其他专业

北京大学医学部在基础医学方面相当强，且其综合学科优势使得其在多个临床医学重点领域如心血管疾病、肿瘤学、神经科学等方面都有深入的研究和实践。

建议

如果你对临床医学感兴趣，尤其是希望在国际顶尖的临床教学和研究平台上发展，北京协和医学院可能是更好的选择。

如果你希望在医学领域从事科研或希望利用北京大学的综合学科优势，北京大学医学部可能更适合你。

如果你对护理学有浓厚的兴趣，北京协和医学院的护理学专业无疑是首选。

最终选择哪个学校和专业，建议结合你的个人兴趣、职业规划以及家庭背景等因素进行综合考虑。