本科合并批次的原因主要有以下几点：

消除录取分隔和偏见：

合并本科批次有助于打破过往招生批次带来的人才招收录取壁垒，科学遵循人才选拔与培养规律。这样可以消除社会招聘中因为招生批次诞生的偏见，比如“面试官只通过一本毕业生”这类的情况，让社会招聘更对应毕业生实际情况，而不是用一个标准限死。

促进平等竞争：

合并本科批次可以消除因批次划分可能带来的政策歧视，促进普通高等学校平等竞争。普通高等学校不再靠人为划分层次吸引生源，而是靠提高办学质量得到社会和考生认可。

增加选择机会：

对考生而言，合并批次增加了选择机会，引导他们根据个人兴趣和特长理性选择学校和专业，促进考生健康成才成长。

淡化层次观念：

合并批次有助于淡化以录取批次评价高校层次的观念，促进高等教育公平发展。

专注发展特色专业：

合并批次有利于高校专注发展特色专业，提升办学水平和核心竞争力。

响应国家政策：

根据《国务院关于深化考试招生制度改革的实施意见》，国家旨在逐步取消高校招生录取批次，合并批次是这一改革方向的具体体现。

适应高等教育普及化阶段：

随着我国高等教育的发展，高等教育进入普及化阶段，高考录取方式也需要进行相应改变。分批次进行录取，只是为便于录取工作操作，与院校性质无关。合并本科二批、三批有利于消除社会对本三录取的高校毕业生的偏见，推动民办本科院校和独立学院发展，有利于今后高校毕业生平等就业。

综上所述，本科合并批次主要是为了消除录取分隔和偏见，促进平等竞争，增加选择机会，淡化层次观念，专注发展特色专业，响应国家政策，并适应高等教育普及化阶段的需求。