马原的方法论主要是指 辩证唯物主义和历史唯物主义，这是马克思主义最根本的世界观和方法论。它包括以下几个方面的内容：

辩证唯物主义

认识论：强调经验事实先于理论而存在，知识来源于实践。主张以现实的“市民社会”和人的活动作为哲学思考的重心。

辩证法：认为客观世界的各种矛盾与对立的现象是内在于事物之中的、具有动态特征的认知关系。社会历史的发展是人类生产力及其所创造的社会关系的辩证发展过程。

历史唯物主义

社会历史观：认为社会历史的发展是由生产力和生产关系的矛盾运动推动的。只有通过对历史过程的认识才能解释人们的社会活动。

上层建筑：知识的发展也是一个辩证过程，因为人类所认识的世界，不一定是真实的世界，而是经过思想加工的文化世界，这种文化世界体现了人类所创造的思想产物，即社会价值、社会制度、社会关系和意识形态等上层建筑。

具体研究方法论

矛盾分析法：承认矛盾、正视矛盾、分析矛盾、解决矛盾。具体问题具体分析，在对立中把握同一，在同一中把握对立。

实践检验：用实践检验人们的认识，要善于正确地运用多种多样的科学实验和典型试验的方法。

历史方法和逻辑方法的统一：在认识中还必须贯彻历史方法和逻辑方法的统一，力求全面性，从事物的发展、运动、变化中观察事物。

政治立场

最广大人民的根本利益：这是马克思主义最鲜明的政治立场，首先是由马克思主义理论的本性决定的。

工作方法

一般和个别相结合：在集中和坚持过程中，必须采取一般号召和个别指导相结合的方法。

领导和群众相结合：从群众中集中起来又到群众中坚持下去，以形成正确的领导意见。

其他方法论原则

整体性、开放性的观念：善于分析事物的具体联系，从动态中把握事物的普遍联系。

发展、过程的眼光：一切事物只有经过一定的过程，才能实现自身的发展。

质量互变规律：重视量变，勇于质变；不以善小而不为，不以恶小而为之。

这些方法论原则为人们提供了认识世界、改造世界的根本思想方法和工作方法，帮助人们在实际工作和生活中科学地分析问题、解决问题。