三本学校收费较高的原因主要包括以下几点：

民办和独立院校性质：

三本大学通常是民办或独立学院，没有国家财政拨款，其运营和开支主要依赖学生学费。

盈利目的：

与公立大学主要以培养人才为目的不同，民办大学更倾向于盈利，学费成为其主要收入来源之一。

教学资源和设施投入：

为了提供良好的教学和研究环境，三本大学需要投入较多的教育资源，包括实验室设备、图书资料、教师培训等，这些都会增加学校的运营成本，从而导致学费相对较高。

教育投资不足：

由于教育投资经费的缺乏，三本大学难以获得足够支持以改善教学环境和提升教学质量，因此提高学费成为一种补偿手段。

资源分配不均：

教育资源在地区间分配不均，一些省份的三本学校由于竞争激烈，可能需要通过提高学费来维持运营。

市场需求和竞争压力：

三本大学面临激烈的市场竞争，需要不断提升教学质量和学生就业竞争力，这要求更多的资源和资金投入，这也是导致学费偏高的一个原因。

建设成本高：

三本大学往往提供更好的教学和生活设施，如双人间或四人间宿舍、独立卫浴和空调等，这些都需要较大的经济投入。

品牌使用费：

独立学院通常需要向母体高校支付品牌使用费，这也是其学费较高的一个原因。

综上所述，三本学校收费较高的原因主要是其民办和独立院校的性质、盈利目的、对教学资源和设施的高投入、教育投资不足、资源分配不均、市场需求和竞争压力、建设成本高等多方面因素共同作用的结果。