南京理工大学自动化专业之所以好，主要原因可以归纳为以下几点：

优势特色研究方向：

南京理工大学的自动化学院形成了复杂结构控制系统基础理论、复杂环境自主运动平台导航与规划、复杂武器系统指挥决策与火力控制、复杂系统智能检测与运动控制技术等优势特色研究方向。这些方向不仅具有强大的科研能力，还能为学生提供前沿的科研平台与资源。

高质量的教育教学：

学院在教育教学上能够带给学生高质量的学习体验，有助于培养学生的科研素养和创新能力。

学科与科研转化：

本专业高度重视学科建设向专业建设的渗透和高水平科研成果向本科教学的转化，构建了一套培育系统设计师的实践教学体系，对学生科研素养和创新能力的培养起到了极大的促进作用。

专业方向的多样性：

自动化专业由运动控制系统和过程控制系统、综合自动化系统以及嵌入式控制系统三个专业方向构成，涵盖了自动控制理论的多个应用领域。

高声誉和竞争力：

南京理工大学的自动化专业在全国具有较高的声誉和竞争力，毕业生就业前景广阔，适应面宽。

强大的师资队伍：

学院拥有一支高水平的师资队伍，许多教师具有丰富的科研和教学经验，为学生提供了良好的学习环境。

广泛的学术交流：

南京理工大学与多所高校和研究机构建立了良好的合作关系，通过举办国际会议、讲座等活动，鼓励学生参与国际学术交流和实践。

良好的就业前景：

自动化专业属于信息产业，这是一个朝阳产业，就业前景非常看好。南京理工大学的自动化专业毕业生在就业市场上表现优秀，起薪较高。

综上所述，南京理工大学的自动化专业在教学、科研、就业等方面都有显著的优势，是一个值得考虑的选择。