北京自主出卷考试的原因主要有以下几点：

适应首都地区的特殊情况和需求：

北京作为中国的首都，拥有独特的历史文化和人文资源，这些元素需要更好地融入到高考中，以体现出北京特色和文化。自主命题可以更灵活地选择内容和形式，更好地符合北京地区教学特点和要求，考察更加贴近实际的能力。

反映北京地区的教学水平和科研能力：

北京的教育旨在更好地反映当地的教学科研水平，选拔优秀人才，推进地方的发展。自主命题能够更准确地评估北京地区学生的知识水平和应试能力。

满足多元化的教育职能要求：

由于中国国土辽阔，各地社会发展不一，教育水平参差复杂，全国统一考试无法满足这些多元化的教育职能要求。自主命题可以更好地满足对教育高职能的要求，同时对教育后进地区进行帮扶，实现教育公平。

推动教育资源的均衡化：

使用地方卷子可以促进各地教育的发展，推动教育资源的均衡化。自主命题有助于北京与其他地区在教育资源上的交流和共享。

维护高考制度的公平性：

尽管存在全国统一的呼声，但由于各地教育水平和需求的差异，自主命题在一定程度上维护了高考制度的公平性。北京、上海、天津、江苏和浙江等省份的自主命题，尽量确保每个学生都能接受更公平的评价。

综上所述，北京自主出卷考试是为了更好地适应首都地区的特殊需求，反映北京地区的教学水平和科研能力，满足多元化的教育职能要求，推动教育资源的均衡化，以及维护高考制度的公平性。