南京大学和东南大学都是中国顶尖的985双一流高校，各有其优势专业。以下是一些关键点的比较：

综合实力排名

南京大学在全国的综合排名中通常位列前十，而东南大学则位于前二十之内。南京大学在C9联盟中占据一席之地，显示出其较高的学术地位。

专业优势

南京大学：

王牌专业：计算机科学与技术、生物学、物理学、化学、经济学、新闻学、地质学、软件工程、水文与水资源工程等。

其他优势专业：天文学、大气科学等。

东南大学：

王牌专业：建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、艺术学理论等。

其他优势专业：电子科学与技术、软件工程、交通工程、自动化、电气信息等。

就业前景

从就业角度来看，工科专业如计算机科学、软件工程、土木工程等通常更受欢迎，就业前景较好。南京大学和东南大学的这些专业都有很高的就业率。

学科布局

南京大学：

更加强调人文社科，如哲学、历史学、经济学等，同时也拥有强大的理工科实力。

东南大学：

以工科为主，特别是建筑学、土木工程、交通工程等，同时在生物医学工程领域也表现突出。

建议

如果你对人文社科有浓厚兴趣，南京大学可能是更好的选择。

如果你对工科，特别是建筑、土木、交通、电子、计算机等方向感兴趣，东南大学可能更适合你。

最终选择哪所大学，建议结合个人的兴趣、职业规划以及未来的发展方向来综合考虑。