北京协和医学院和北京大学医学部都是中国顶尖的医学教育机构，各有其优势专业。以下是一些建议：

临床医学

北京协和医学院的临床医学专业被认为是国内顶尖水平，具有很高的声誉和影响力。

北京大学医学部的临床医学专业也非常强，尤其是其八年制本硕博连读项目，在全国排名第一。

护理学

北京协和医学院在护理学方面也有很好的口碑。

基础医学

北京大学医学部在基础医学方面相当强，尤其是其科研实力和教育质量。

药学

北京协和医学院和北京大学医学部的药学都是其优势专业，协和的药学专业列入了世界一流大学和一流学科建设学科名单。

其他专业

北京协和医学院在预防医学、口腔医学、神经学科、骨科、妇科、儿科、影像学专业等方面也非常出色。

北京大学医学部在经济学、计算机科学、生物信息学等领域也有很好的表现。

建议

如果你希望从事临床医学工作，并且希望获得更高的学历和更好的声誉，北京协和医学院是更好的选择。其八年制本硕博连读项目能够提供全面而深入的医疗教育和研究训练。

如果你希望在医学领域从事研究或教学工作，并且希望利用北大的综合学科优势，北京大学医学部可能更适合你。其基础医学和药学专业在全国具有很高的排名和影响力。

如果你对特定领域如护理学、预防医学等感兴趣，北京协和医学院在这些专业方面也有很好的表现。

最终选择哪个学校和专业，建议结合你的个人兴趣、职业规划以及家庭和学校的实际情况进行综合考虑。