大连大学中， 计算机科学与技术 和 软件工程 被认为是最好的专业，这两个专业在国内享有较高的声誉，并且依托强大的师资力量和先进的实验设备，致力于培养学生的计算机技术和应用能力。此外， 电气工程及其自动化 专业也是大连大学的强项，该专业培养能够从事与电气工程有关的系统运行、自动控制、电力电子技术、信息处理等领域工作的宽口径"复合型"高级工程技术人才。
根据以上信息，可以认为大连大学中计算机科学与技术系和软件工程系的教学质量和专业水平是最高的。当然，选择哪个系更好，还需根据个人的兴趣和职业规划来决定。
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