高考取消自主命题的主要原因包括：

提高公平性和科学性

避免主观性和局限性：地方命题可能存在主观性和局限性，使用全国卷可以保证人才选拔的公正性。

适应全国高考标准：使用全国卷有助于学生更好地适应全国高考的考试形式和标准，从而在高考中取得更好的成绩。

命题风险加大

安全性问题：高考本身的高风险、高利害特点要求必须公平、公正，而且要高度保密。分省自主命题增加了命题组织管理的泄密风险。

命题质量下降：由于历史原因，一些省份缺乏综合类重点高校和稳定的命题队伍，导致命题质量难以保证，甚至出现“超纲”现象和疏漏。

不利于人才合理流动

社会公平原则：分省自主命题可能使高校录取难度进一步加大，不利于人才的合理流动和社会公平原则。

高考权威性受到挑战

与国际趋势不符：全国统一命题有助于保持高考的权威性和高效性，削弱高考统一性可能与国际大学入学考试制度的发展趋势不符。

安全保密风险：实行分省命题意味着每个省都要花很大气力来做安全保密工作，可能存在更多的安全隐患。

高校录取标准

录取难度：重庆地区高考难度较大，自主命题可能使高校录取难度进一步加大，不利于该地区高校的市场竞争力。

综上所述，高考取消自主命题主要是为了提高公平性、科学性、安全性和权威性，同时也有利于人才的合理流动和社会公平原则。