高考外语选日语的学生在报考专业时确实存在一些限制，主要涉及以下几类专业：

军事和国防类专业：

这些专业通常要求考生具备较高的英语水平，以满足国家安全、机密以及设备操作等方面的需求。例如，国防科技、军事指挥等专业。

英语专业及外贸相关专业：

这些专业的研究和学习重点集中在英语语言、文学和商务英语沟通方面，对考生的英语水平有较高要求。例如，英语语言文学、商务英语、国际经济与贸易等专业。

传媒、国际关系、外交类专业：

这些专业通常涉及国际交流、文化传播等领域，需要考生具备良好的英语沟通能力。例如，广播电视编导、新闻学（国际新闻方向）、国际关系、外交学等专业。

部分医学、法学专业：

这些专业涉及大量的专业术语和国际交流，通常需要考生具备较高的英语水平。例如，临床医学（涉外方向）、法学（国际法方向）等专业。

语种教学限制：

部分高校虽然开设了日语专业，但在课程设置和教学上可能会有一定的限制。例如，一些高校可能会要求日语专业的学生必修英语或其他外语课程，以满足学科交叉和国际化教育的需求。

学习资源限制：

由于中国的日语教育市场相对较小，且部分高校对日语专业的投入不足，因此日语专业的学生在学习资源上可能会受到一定的限制。

就业前景限制：

虽然大部分院校不会限制日语类高考生，但仍有部分与英语相关性强的专业，如计算机、软件、翻译、对外经贸等，日语考生需要谨慎报考。

综上所述，高考外语选日语的学生在报考专业时，主要受限的专业包括军事和国防类专业、英语专业及外贸相关专业、传媒、国际关系、外交类专业、部分医学和法学专业，以及部分与英语相关性强的专业。建议学生在选择专业时，仔细查阅目标院校的招生简章，了解具体的专业限制和要求。