深圳自考的缺点主要包括以下几点：

考试难度较大：

深圳自考对考生的学习能力、时间精力等要求较高，需要认真学习、复习和多做练习题。对于学习能力一般或时间精力有限的考生来说，可能会面临较大的挑战。

考试科目多：

深圳自考的考试科目一般在11-18门之间，考生必须一门门通过才能申请毕业。部分跨专业的考生还需要加考2-4门课程，这无疑增加了学习的难度和时间成本。

专业选择有限：

经过几次停考后，深圳自考的专业选择范围有所减少，主要集中在热门专业如经管类、文史教育等，而医学、理工科等专业的选择相对较少。这在一定程度上限制了考生的专业选择。

通过率不高：

由于自考本科的难度较大，且大部分考生为上班族，学习时间有限，因此通过率相对较低。自学方式的通过率更是最低。

学习时间和精力要求高：

自考本科通常需要在工作之余或空闲时间进行学习，学习时间相对分散，难以连续投入大量时间进行学习。这对于需要大量阅读和理解的学科来说，可能会影响学习效果。

缺乏学习氛围和社交机会：

自考本科主要以个人学习为主，缺乏同学或老师的互动和指导，没有同学讨论、学习小组和班级活动等，难以形成良好的学习氛围。同时，自考学生大都在工作中，社交圈主要是工作圈子，学习时间长，社交机会较少。

学位要求高：

自考本科生想要获得学位证，需要满足一定的条件，如通过学位英语考试、达到院校平均分要求等。这些要求对于一些考生可能存在一定的挑战，需要更多的努力才能达到申请学位证的标准。

考试时间和安排问题：

深圳自考的笔试安排基本上是固定的，一次最多考4门，而双自考的课程总数最少都在25门左右，按照一年考过8-10的进度计算，最快也只能三年到三年半左右考完。这可能导致学习时间过长，压力较大。

综上所述，深圳自考的主要缺点集中在考试难度、专业选择有限、通过率不高、学习时间和精力要求高、缺乏学习氛围和社交机会等方面。建议考生在选择自考时，要充分考虑自身的学习能力和时间精力，选择合适的专业，并制定合理的学习计划。