如果专升本被自动退档，可以采取以下步骤办理：

联系录取学校招生办

及时与录取你的学校招生办公室取得联系，说明退档原因，并按照学校规定办理退档手续。在联系时，准备好你的个人信息、退档原因等相关证明材料，以备后续需要。

了解退档原因

与招生办公室联系，了解退档的具体原因。这有助于你判断退档是否合理，并为下一步行动提供依据。

申请复查或申诉

如果你对退档原因不满意，可以准备相关证据和申诉材料，向学校提出申诉。同时，你也可以咨询教育部门或学生维权组织，寻求帮助和建议。

填报征集志愿

如果退档是由于一些可弥补的原因（例如分数未达到专业分数线但不服从调剂），你可以参加征集志愿。征集志愿的填报时间和方式与普通志愿填报相同，但可选的院校和专业较少。选择服从调剂可以增加被录取的机会。

考虑复读

如果征集志愿没有被录取，且你不愿意参加下一批次的录取，那么选择复读可能是一个更好的选择。通过一年的努力，你可以提高自己的成绩，从而考上理想的大学。

确认退档成功

主动退档需要学校已经办理了退档手续，并且你已经确认退档成功。有些省份对主动退档有惩罚措施，例如限制报考学校的数量，因此务必确认清楚相关规定。

注意时间限制

办理退档手续时，要注意时间限制，确保在规定的时间内完成所有手续，以免影响后续的录取流程。

办理退学手续

另一个选择是办理退学手续，但这意味着你将失去再次被录取的机会，只能选择重新复读一年。在办理退学手续前，务必了解所有相关政策和流程。