甘肃自考毕业证的申请流程如下：

网上申报

登录甘肃教育考试院官网，进入自学考试考务考籍管理系统综合业务平台进行毕业预申请，上传所需材料并确认预申请。

现场确认

在规定时间内，携带以下材料到所在市自考办进行现场确认：

《准考证》

《身份证》

全部《课程合格证》

办理本科毕业证者还需携带专科及以上毕业证原件。

填写《毕业生登记表》，并由单位（非在职人员由街道办事处或乡人民政府）签署意见后，在规定时间内送交当地自学考试办公室报所在市自学考试工作委员会和省考委审核。

材料审核

市自考办初审合格后，发给《毕业生登记表》，考生需认真校对并签字确认。如有信息错误，考生需承担相应后果。

审核通过后，由省、自治区、直辖市考委颁发相应的毕业证书，主考学校在毕业证书上副署。

领取毕业证

审核合格的考生，携带相关领证材料到指定地点领取毕业证书及毕业生档案。具体领取地点可能因市而异，建议提前联系当地自考办获取详细信息。

注意事项：

申请毕业的考生必须完成所选专业考试计划规定的全部课程（含实践性环节考核、本科毕业设计或毕业论文）并取得合格成绩。

申请本科毕业证书者，必须具有国家承认学历的专科及以上毕业证书。

提交的申请材料必须真实有效，如有隐瞒或造假，将取消毕业资格。

建议提前规划好时间，确保所有材料准备齐全，按时完成网上申报和现场确认，以确保顺利申请到自考毕业证书。