专升本退档的办理流程如下：

联系录取学校招生办

与被录取的专科学校招生办公室取得联系，说明退档原因，并按照学校的规定办理退档手续。在此过程中，务必保存好所有相关证明，以备后续需要。

申请退档和补录

如果考生对录取的专科院校不满意，可以向学校提出退档申请，并立即申请补录到其他学校。考生需要在招生办公室填写补填志愿表。需要注意的是，如果没有学校愿意补录，考生可能会面临无学可上的情况。

办理退学手续

另一个选择是办理退学手续，但这意味着考生将失去再次被录取的机会，只能选择重新复读一年。办理退学手续前，考生需要与录取院校联系，了解具体退档政策和流程。

填写退档申请表

在学校指定的时间内填写退档申请表，学校通常会在每个学期开学初或者特定的退学申请期间提供退档申请表，学生需要填写基本个人信息和退档原因等相关信息。提交退档申请表后，学校会根据申请的情况进行审批，并通知学生审批结果。

办理手续

如果申请退档获批，学校会通知学生进行相关手续办理，如交还学生证、结清学费和住宿费等。具体手续办理流程根据学校的规定而有所不同。

保存相关证明材料

在整个退档过程中，考生需要保存好所有相关的证明材料，以备后续需要使用。这些材料可能包括身份证、准考证、录取通知书等。

了解退档原因并申请复查或申诉

如果专升本被自动退档，考生需要与招生办公室联系，了解退档的具体原因。如果对退档原因不满意，可以准备相关证据和申诉材料，向学校提出申诉。同时，也可以咨询教育部门或学生维权组织，寻求帮助和建议。