在自动化专业考研中，选择科目需要考虑以下几个方面：

核心科目

控制理论与控制工程：这是自动化专业的核心基础，涉及系统建模、控制方法和控制系统设计等内容。掌握这一科目能够为自动化专业的深入学习和研究打下坚实基础，也是未来从事自动化工程和研究的必备技能。

自动控制原理：这是自动化专业的基础课程，涉及系统的动态行为、稳定性分析、状态空间表示等。对于考研来说，这也是一个重要的科目。

专业方向

控制工程：应用控制理论解决实际问题的实践性科目，包括控制系统设计、参数调节和系统优化等。这个方向与工业应用紧密相关，就业前景较好。

模式识别与智能系统：研究模式识别、智能系统、机器人、自动化检测等方面，是近年来比较热门的人工智能方向。

导航制导与控制：主要针对航空航天、军工等领域的高精端控制方法研究与应用。

检测技术与自动化装置：实用性强，主要针对自动化装置进行控制和应用。

系统工程：结合多个方向的算法和应用，主要与算法打交道。

考试科目

初试科目：一般为政治、数学一、英语一和自动控制原理。其他科目可能包括数学二、电路、信号与系统、电子技术基础等，具体科目需参考各高校的招生简章。

研究方向：不同的研究方向可能需要不同的专业背景和技能，选择时可以根据自己的兴趣和职业规划来决定。

建议

兴趣优先：选择自己感兴趣的方向，有利于长期的学习和研究。

就业前景：了解各个方向的就业前景，选择就业前景好的方向可以提高就业竞争力。

实际情况：结合自己的实际情况，如本科阶段的学习背景、实验室经历、项目经验等，选择最适合自己的方向。

通过以上分析，可以选择出最适合自己的考研方向和科目，为未来的学习和职业发展打下坚实的基础。