跨境电商专业在全国许多高等院校都有设置，以下是一些比较有知名度和优势的高校：

上海财经大学-ACMr国际贸易学院：

该学院下设跨境电商系，开设了本科、硕士和博士多个层次的跨境电商相关专业，是中国首家开设跨境电商专业的高等院校。

电子科技大学电子商务学院：

该学院是国内第一家正式成立电子商务学院的高校，下设跨境电商大数据研究所和渠道创新研究所，着眼于跨境电商的研究和实践。

华东师范大学经济与管理学院：

该学院开设了跨境电子商务专业，重点培养跨境电商企业管理、国际商务谈判、合同操作等实用技能。

北京航空航天大学经济管理学院：

该学院开设了国际电子商务专业，着重培养学生的国际商务、跨文化交流、电子商务等技能。

浙江工商职业技术学院：

该学院拥有多个国家级、省级专业，其中跨境电商专业是省级高水平建设专业群之一。

盐城幼儿师范高等专科学校、 上饶幼儿师范高等专科学校、 抚州幼儿师范高等专科学校、 北京交通职业技术学院、 北京农业职业学院、 北京经济管理职业学院、 北京交通运输职业学院、 天津滨海职业学院、 天津商务职业学院、 天津国土资源和房屋职业学院等。

中国传媒大学、 北京城市学院、 河北水利电力学院、 河北工程技术学院、 山西晋中理工学院、 山西工商学院、 太原工业学院、 沈阳航空航天大学、 大连工业大学、 大连外国语大学、 大连理工大学城市学院、 大连财经学院等。

这些学校在全国跨境电商专业方面具有较高的知名度和优势，涵盖了本科、硕士和博士多个层次，并且注重实践和研究。建议在选择学校时，可以根据自身兴趣、专业方向和职业规划，综合考虑学校的师资力量、教学设施、实习机会以及就业前景等因素。