福建自考档案存档位置有以下几种选择：

毕业院校：

如果暂时没有找到工作，可以将档案暂存在毕业院校，学校可代为保管两年，但建议尽早找到单位存档。

人才中心：

对于没有工作单位或单位没有档案管理权限的自考生，可以将档案存放在当地人才交流中心或与单位合作的托管机构。人才中心是国家指定的档案管理单位，可以确保档案的完整性和安全性。

留学服务中心或人事代理机构：

计划留学的自考生可以将档案存放在留学服务中心或人事代理机构。

工作单位：

如果自考生进入机关、事业单位或国企工作，档案会由工作单位接收，与户口一并管理。如果单位具备档案管理权限，这是最直接和方便的选择。

户籍所在地人力资源公共服务机构：

对于没有单位可存放的情况，可以到户籍所在地的人力资源公共服务机构申办个人委托存档。这种方式适用于没有统招学历的自考生，档案一般保存在户籍所在地的人才市场或人社局。

私企或外企：

就职于私企或外企的自考生，可将档案放在当地人才交流中心或与单位合作的托管机构。

基层锻炼：

前往基层锻炼的自考生，档案会转移到工作所在地的县级政府人社部门。

无论选择哪种存档方式，都需要确保档案的完整性和安全性，并定期检查档案的状态，确保其未被篡改或损坏。建议尽早确定存档机构，并将档案存放在有管理权限的地方，以便于今后的使用和管理。