软件工程硕士（Master of Software Engineering，MSE）是一种工程硕士领域的学位，专门培养在软件开发、项目管理和系统设计等领域具有高水平专业知识和实际应用能力的高级人才。它不同于传统的计算机科学或软件学科教学体系，更注重课程设计、教师队伍和职业设计的国际化，旨在培养能够胜任大中型复杂软件系统开发和管理的实用型、工程型、复合型软件高级人才。毕业生通常在各大软件公司、企事业单位、高等院校、研究所和国防等部门从事软件相关工作。
软件工程硕士项目通常包括全日制和在职两种学习形式，其中在职项目相对容易考取。在中国，软件工程硕士教育由教育部直属高校和一些示范性软件学院负责实施，如华中科技大学等。软件工程硕士的学位代码为085212，并与工程领域的任职资格相联系。
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