日本申请博士可以考虑的大学包括但不限于以下几所：

东京大学

简称东大，日本学术殿堂和帝国大学之首。

QS世界排名：23。

优势专业：所有专业无明显短板。

语言申请建议：文商科N1-140，理工医药N2-140，托福成绩90。

京都大学

简称京大，和东大并称为日本的“清华北大”，被誉为“科学家的摇篮”。

QS世界排名：33。

优势专业：医学、法学、工学、理学。

语言申请建议：文商科N1-140，理工医药N2-140，托福成绩90。

东京工业大学

简称东工大，日本理工科大学之最，被誉为“亚洲的麻省理工学院”。

QS世界排名：56。

优势专业：所有工学、理学均为优势专业。

语言申请建议：理工科N2-140，托福成绩90。

庆应义塾大学

简称庆大，与早稻田大学并称“私立双雄”，被誉为“企业家的摇篮”。

QS世界排名：201。

优势专业：法学、文学、经济学、商学、医学。

语言申请建议：文商科N1-140，医药理工N2-140，托福成绩90。

早稻田大学

简称早大，留学生人数居日本所有大学之首。

QS世界排名：203。

优势专业：政治经济学、法学、商学、理工学。

语言申请建议：文商科N1-140，理工科N2-140，托福成绩90。

一桥大学

简称一桥，专攻人文学与社会科学的小规模精英院校，被誉为“亚洲的哈佛”。

人文学社会科学日本排名：

1。

优势专业：经济学、社会学、商学、文学。

语言申请建议：文商科N1-140，托福成绩90。

名古屋大学

医学研究科在继承历史的基础上，从诊疗和研究两个方面不断培养出人才。

QS世界排名：

152。

优势专业：临床医学。

以上信息可以作为参考，但请注意，申请博士时还需考虑个人研究方向、导师匹配度、语言成绩、研究计划书等因素。建议联系专业的留学顾问或教授获取最新的申请信息和建议