自动化专业考研时，通常需要考数学二。数学二主要适用于工学类的一些专业，包括但不限于控制科学与工程、计算机科学与技术等。具体到自动化专业，以下是一些可能需要考数学二的专业类别：
控制科学与工程：
这是自动化专业的一个重要分支，考研时多数院校会要求考数学二。
计算机科学与技术：
自动化专业与计算机科学紧密相关，许多自动化专业的研究生课程也会包含计算机科学的内容。
机械工程、 材料科学与工程、 电气工程及其自动化、 电子科学与技术、 信息与通信工程、 建筑学、 土木工程、 水利工程、 测绘科学与技术、 交通运输工程、 船舶与海洋工程、 环境科学与工程、 生物医学工程等专业：这些专业在考研时也可能需要考数学二。
考生应根据自己报考的学校和专业的具体要求，选择相应的考试科目进行准备。
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