云南省拥有一些知名的大学，以下是部分较为突出的高等教育机构：
云南大学
211工程、双一流大学
教育部与云南省共建
世界一流学科建设学科：民族学、生态学
昆明理工大学
综合性重点大学
国防科技工业局与云南省共建
卓越工程师教育培养计划
云南师范大学
师范类高等教育机构
云南农业大学
卓越农林人才教育培养计划
昆明医科大学
医学高等教育机构
云南财经大学
财经类高等教育机构
云南中医药大学
中医药高等教育机构
云南民族大学
民族类高等教育机构
大理大学
综合类高等教育机构
西南林业大学
林业类高等教育机构
以上排名不分先后，且信息可能随时间有所变化。云南共有高校91所，包括本科学校33所和专科学校58所。
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