澳门最好的大学是澳门大学。澳门大学，简称澳大，是澳门第一所现代大学，也是澳门唯一的公立综合性大学。

该校前身为由香港、澳门、东南亚等地的知名人士资助开办，1981年3月28日成立的私立东亚大学。2009年12月20日，澳门大学新校区在横琴岛开工建设。2013年11月5日，投资逾百亿的澳门大学新校区已经正式启用。2015年9月22日上海交通大学世界一流大学研究中心发布的中国两岸四地大学排名中，在中国两岸四地高校中列第49位，澳门地区第2位。根据《泰晤士高等教育》公布2014/15年度世界大学排名榜，澳门大学晋身世界大学前三百名，位列二百七十六至三百名之间，与上海交通大学并列。

2015年公布的全球创校50年内最佳100所大学排行榜中，澳门大学跻身第三十九名，在亚洲地区位列第7名。 2015年《泰晤士高等教育》亚洲大学排行榜中，澳门大学名列亚洲地区第40名，位于上海交通大学、中山大学之间。根据《泰晤士高等教育》公布2015年度世界大学排名榜，澳门大学位列世界大学401-500名，与武汉大学并列。根据QS公布的2015年世界大学排名，澳门大学位列世界大学651-700名间，亚洲大学161-170名间，均较2014年上升40-50位。