东南大学浦口校区的系主要有如下系：

东南大学成贤学院的土木工程系、机械工程系、建筑与艺术系、电子工程系、电气工程系、计算机工程系、经济管理系、化工与制药工程系、基础部。

东南大学成贤学院始创于1998年，2003年经教育部批准更用现名，是由“985”“211”重点建设高校东南大学用全新的办学理念和运行模式举办的独立学院，培养普通全日制本科学生。它是东南大学发展事业的重要组成部分，是其在本二层面培养高水平应用型人才、服务国家和社会经济发展的重要窗口。学校具有独立法人资格、独立校园、实行相对独立的教学管理。

学校实行董事会领导下的院长负责制，东南大学校长张广军教授任董事会董事长、法定代表人，东南大学党委副书记郑家茂教授、东南大学总会计师丁辉教授任董事会副董事长，郑家茂教授兼任学院院长。2012年3月，学校顺利完成事业单位法人登记，成为江苏省首批完成事业单位法人登记试点的独立学院。

学校坐落于东南大学本科教学基地——浦口校区，位于南京市江北新区，地理位置优越，交通便捷畅达。地铁三号线贯通东南大学九龙湖校区、四牌楼校区和东南大学成贤学院，形成南京站、南京南站以及市中心的一小时交通圈，学生可最大限度共享东南大学教学资源。