硕士基础数学与学科数学的区别主要体现在以下几个方面：

研究方向 ：

基础数学 ：属于理学领域，侧重于数学理论研究，包括纯数学和应用数学的基础研究。

学科数学 ：属于教育硕士领域，侧重于数学教育，培养能够教授中小学数学的教师。

培养目标 ：

基础数学 ：主要进行学术研究，学习研究生基础课程，如实变函数、泛函分析、拓扑等，并进行论文研究和就业准备。

学科数学 ：旨在培养能够设计和实施数学教学课程、进行教学研究的中小学数学教师，同时也包括实习和就业准备。

课程设置 ：

基础数学 ：课程内容更偏向于数学理论，如数分、高代等，以及进行学术研究的相关训练。

学科数学 ：课程内容包含数学教育相关，如课程标准设计、教学设计、教育研究方法等。

就业方向 ：

基础数学 ：毕业生可能从事数学研究工作，或进入教育、科技、经济等部门。

学科数学 ：毕业生主要成为中小学数学教师。

考试难度 ：

基础数学 ：通常认为考试难度较高，适合有意从事数学研究的学生。

学科数学 ：虽然也需要准备考试，但相对来说，内容可能更加广泛，复习深度不如基础数学深。

学术与应用 ：

基础数学 ：注重数学内部的基础理论和方法的研究，为其他应用性数学学科以及自然科学、工程技术和社会科学等领域提供必要的基础理论、工具和方法。

学科数学 ：侧重于将数学知识应用于中小学教育，培养具有教学能力的专业人才。

综上所述，硕士基础数学与学科数学在研究方向、培养目标、课程设置、就业方向、考试难度以及学术与应用方面都有明显的区别。选择哪个专业取决于个人的兴趣和职业规划。如果对数学理论研究有浓厚兴趣，希望从事数学研究工作，那么基础数学可能更适合；如果希望成为中小学数学教师，那么学科数学可能更合适。