化学系最好的大学包括：

北京大学 ：

化学系 是中国成立最早的化学系，拥有强大的师资力量和学术水平，所有化学二级学科均为重点学科。

清华大学 ：

化学系 曾经是国内高校中师资力量最为雄厚、学术水平最高的化学系之一，1985年化学系正式恢复建立，现已成为国内重要的化学科学研究和人才培养基地。

中国科学技术大学 ：

化学系 成立于1997年，发展迅速，化学专业获评A+，与北大、清华并列第一。

复旦大学 ：

化学系 是教育部审批的国家特色专业，化学专业获评A++。

南开大学 ：

化学系 是985大学和211大学国家双一流大学，化学专业获评A++。

南京大学 ：

化学系 是教育部审批的国家特色专业，化学专业获评A++。

吉林大学 ：

化学系 是教育部审批的国家特色专业，化学专业获评A++。

厦门大学 ：

化学系 是教育部审批的国家特色专业，化学专业获评A++。

浙江大学 ：

化学系 虽然未在上述列表中，但根据2023年学科评估，浙江大学化学学科整体实力强劲，属于顶尖水平。

武汉大学 ：

化学系 是教育部审批的国家特色专业，化学学科整体实力较强。

这些大学在化学学科领域具有极高的学术水平和研究实力，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的学校。