函授考研存在以下劣势：

时间不灵活 ：函授考研需要按照学校规定的时间表进行学习，缺乏自由度，不能根据个人的实际情况进行调整。

学习效果难以保证 ：由于函授考研缺乏现场授课和互动，学生的学习效果可能会受到影响。

缺乏学习氛围 ：函授考研学生大多数是在家里自学，缺乏学习氛围和同学之间的交流，可能会感到孤独和无助。

学历限制 ：部分研究生院校和专业对考生学历有明确要求，这无疑增加了函授本科生考研的难度。

基础知识薄弱 ：函授本科生在学习过程中，受限于教学资源和自身时间安排，基础知识可能相对薄弱。

时间和精力分散 ：函授本科生大多是在职人员，需要在工作、家庭和学习之间进行平衡。相较于全日制本科生，他们投入到考研的时间和精力有限。

报考阶段受限 ：很多院校不能报考函授本科生的研究生，这进一步增加了报考的难度和限制。

复试加试科目 ：函授本科生在考研复试中可能还需要加试科目，这也是一个额外的挑战。

自律性要求高 ：由于函授教育需要学生自我安排学习时间和进度，对学生的自律性要求较高。缺乏自律可能会影响学习效果和考研成绩。

考试难度较大 ：考研涉及的知识面广泛，对学生的知识储备和应试能力要求较高。函授本科生在基础知识、学习方法和时间管理等方面可能相对较弱，这会增加考研的难度。

社会认可度不高 ：虽然函授教育在成人继续教育中有一定的地位，但社会对其认可度仍然不如全日制教育。这可能会影响函授本科生在求职、升学等方面的机会。

就业歧视 ：部分用人单位可能会对函授学历的求职者存在偏见，这可能会限制函授本科毕业生的就业机会。

办学目的商业化 ：函授教育办学目的日益商业化，可能导致教育质量下降，学生接受的教育可能过于功利化，缺乏真正的学术追求和实践能力。

专业设置与课程体系不合理 ：函授教育的专业设置和课程体系可能与社会需求脱节，课程内容可能过于普教化，难以满足成人学习的特殊需求。

综上所述，函授考研在多个方面都存在一些劣势，考生需要根据自己的实际情况和目标，权衡这些劣势，制定合理的备考策略。