软件学院分数低的原因是多方面的，主要包括以下几点：

学费较高 ：软件工程专业的学费相对较高，第三、四学年每年平均学费在13000-16000元之间，这对一些家庭来说是一笔不小的开支，导致报考该专业的学生数量相对较少，尤其是在中西部院校尤为明显。

专业认知度不足 ：软件工程专业开设时间相对较短，许多家长和考生对该专业的了解不够深入，可能认为其就业前景不如其他专业，因此报考意愿较低。

内容难度相对较低 ：有观点认为，软件工程专业在内容难度上可能不如计算机科学与技术专业，计算机专业通常被视为理科，对数学能力要求较高，而软件工程则更侧重于实践和应用，这可能导致一些考生认为软件工程专业的分数较低。

行业发展变化 ：随着人工智能技术的发展，许多基础的编程工作可以由人工智能自动完成，这可能导致企业对单纯只会编写代码的软件工程师需求减少。同时，软件工程师的工作模式逐渐转变为与人工智能协作，更强调创新能力和对复杂业务逻辑的理解，这可能影响考生和家长对该专业的看法。

就业压力 ：软件行业竞争激烈，企业对求职者的技能和经验要求越来越高，这使得刚毕业的软件工程专业学生面临较大的就业压力。这种就业形势的变化可能会影响考生对该专业的选择，进而影响录取位次。

招生规模 ：部分高校软件工程专业的招生规模较大，这也可能导致分数相对较低。

综上所述，软件学院分数低的原因主要包括学费高、专业认知度不足、内容难度相对较低、行业发展变化、就业压力以及招生规模大等因素。