吉林农业大学设有多个学院，涵盖农、理、工、经、管、文、法、教育等多学科领域。截至2025年2月，学校共有20个学院、1个直属教学部门、1个研究生院，以及长春双阳区的吉林农业大学发展学院。以下是主要学院及部分专业设置：

一、主要学院设置

农学院

植物保护与生物技术系、农业经济管理系、作物栽培系等

药材资源与开发系（2024年新增）

资源与环境学院

农业资源与环境、水土保持与荒漠化防治等

经济管理学院

农林经济管理、土地资源管理、工商管理等6个本科专业

食品科学与工程学院

食品科学与工程、粮食工程、酿酒工程等

生命科学学院

生物技术、生物科学、药学等

信息技术学院

物联网工程、计算机科学与技术、数据科学与大数据技术等

园艺学院

园艺、设施农业科学与工程等

动物科学技术学院

动物科学、水产养殖学、动物医学等

工程技术学院

农业机械化及其自动化、农业建筑环境与能源工程等

中药材学院

中药资源与开发、中草药栽培与鉴定等

林学与草学学院

森林培育、草业科学等

人文学院

家政学、社会学、传播学等

外国语学院

英语、日语、法语等

国际交流学院（筹建中）

国际商务、跨文化交际等

成人教育学院

成人本科、成人专科等

二、特色与优势专业

王牌专业 ：作物学（国家重点学科）、兽医学（吉林省重点学科）、食品科学与工程（粮食深加工技术全国领先）

特色专业 ：家政学（全国首批开设）、中药资源与开发（依托长白山资源）、农业资源与环境（省部级重点学科）

三、学科建设

学校拥有10个博士学位授权一级学科、9个博士后科研流动站、21个硕士学位授权一级学科，13个省级特色高水平学科，多个学科进入ESI全球排名前1%。农业领域科研与人才培养为核心，与牧原、正邦等企业合作紧密。

以上信息综合了学校官网及权威平台数据，具体专业设置以最新官方公告为准。