学校出租商铺需要缴纳以下税费：

印花税

印花税是对书立合同的行为缴纳，新的转租合同是新的行为，因此需要缴纳印花税。印花税的计算公式为：租金总额 × 0.1%。

房产税

房产税由产权所有人缴纳，如果产权属于全民所有，则由经营管理的单位缴纳。房产税的计算公式为：租金总额 × 12%。

土地使用税

土地使用税按房屋地段每平方米征收，具体税额以代征机关实际征收为准。

增值税

出租商铺需要缴纳增值税及相关附加税。如果月租金收入超过20000元，按服务业—租赁业依5%的税率缴纳增值税，同时需要缴纳城建税、教育费附加、防洪费和地方教育附加。

个人所得税

个人所得税按财产租赁所得计算，每次收入不超过4000元的，减除费用800元；

4000元以上的，减除20%费用，其余额为应纳税所得额，依10%的税率计算缴纳个人所得税。在计算个人所得税时，可以扣除财产租赁过程中缴纳的税费和实际开支的修缮费用。

建议

合同签订：在签订商铺租赁合同时，务必明确各项税费的责任方和缴纳方式，避免后续出现纠纷。

税务咨询：由于不同区域的税收政策可能存在差异，建议在签订租赁合同前咨询当地税务机关或专业税务顾问，确保合法合规地缴纳各项税费。

凭证管理：在租赁过程中，妥善保管相关凭证，如维修费用发票等，以便在计算个人所得税时能够提供有效凭证。