北京师范大学水科学研究院成立于2005年1月， 是由中国科学院院士刘昌明先生和林学钰先生共同发起成立的。水科院拥有教育部工程研究中心1个、教育部高等学校学科创新引智基地1个、北京市重点实验室1个、粤港澳联合实验室1个。在2024年软科世界一流学科排名中，北京师范大学的水资源工程世界排名第七、中国排名第五。近年来，水科院先后完成国家水污染控制与治理科技重大专项（水专项）项目、国家重点研发计划项目、国家自然科学基金重点项目、国家社会科学基金重点项目等项目多项。
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