学校计算加班的方式主要依据《劳动法》和相关规定，以下是具体的计算方法和标准：

加班时间计算

白天加班：超过四小时按一天计算，四小时以内按半天计算。

晚上加班：超过两小时按一天计算，两小时以内按半天计算。

法定工作日延长工作时间：一律视为正常上班，不算加班。

加班审批

加班前应提前通知办公室。

存在特定情况不能审批为加班，如效率低下、工作质量低劣、超过加班审批时间等。

加班补助

标准工时制下的加班费：

延时加班费 = （工作日实际工作时间 - 正常工作时间） × 加班费基数 × 150%。

休息日加班费 = 休息日工作时间 × 加班费基数 × 200%。

法定节假日加班费 = 法定节假日工作时间 × 加班费基数 × 300%。

综合工时制下的加班费：

延时加班费 = （实际工作时间 - 正常工作时间 - 法定节假日工作时间） × 加班费基数 × 150%。

法定节假日加班费 = 法定节假日工作时间 × 加班费基数 × 300%。

补助标准：通常为50元/天（半天为25元）。

外出培训

外出培训不算加班，但赐予补助，标准为每天50元（不管饭）或每天8元（管饭）。

其他规定

加班必须达到既定目标和领导要求，未完成工作任务不算加班。

教职工在正常工作日未能完成的分内工作，不视为加班。

学校尽量尊重教职工的休息权，无特殊情况或上级安排的，既定时间内必须完成的工作外，尽量尊重教师的休息权。

综上所述，学校在计算加班时，会综合考虑加班时间、审批流程、补助标准等因素，并遵循相关法律法规的规定。建议教职工在加班前提前与办公室沟通，确保加班记录的准确性和合法性，以便顺利获得加班补助。