大连海事大学和上海海事大学的院系设置如下：

大连海事大学的院系包括：

1. 航海学院

2. 轮机工程学院

3. 信息科学技术学院

4. 交通运输管理学院

5. 交通与物流工程学院

6. 法学院

7. 环境科学与工程学院

8. 人文与社会科学学院

9. 外国语学院

10. 数学系

11. 物理系

12. 体育工作部

13. 专业学位教育学院

14. 继续教育学院

15. 船舶导航系统国家工程研究中心

16. 航运发展研究院等16个教学科研单位。

上海海事大学的院系包括：

1. 商船学院

航海技术系

轮机工程系

船舶电子电气工程系

能源与动力工程系

2. 交通运输学院

交通工程系

管理系

物流管理系

国际航运系

3. 经济管理学院

物流经济系

国际经济贸易系

金融学（海运金融）

财务与会计学系

财务管理

工商与旅游管理系

4. 物流工程学院

机械工程系

机械电子工程（物流装备控制与安全）

工业工程系

物流管理与工程类

物流工程

电气自动化系

电气类

电气工程及其自动化

自动化

测控技术与仪器

5. 法学院

法律系

法学（海商法）

6. 信息工程学院

计算机科学系

信息管理与信息系统

网络工程

人工智能

电子工程系

电子信息类

电子信息工程

通信工程

7. 海洋科学与工程学院

海洋环境系

安全科学与工程系

港口航道与海岸工程系

船舶与海洋工程系

海洋材料系

8. 文理学院

数学系

信息与计算科学

数学与应用数学

9. 马克思主义学院

行政管理系

10. 徐悲鸿艺术学院

工业设计系

视觉传达设计系

绘画系

11. 物流科学与工程研究院

12. 上海高级国际航运学院

13. 高等技术学院

14. 继续教育学院。

建议您根据自己的兴趣和专业方向，选择相应的学院和专业进行深入了解。