新疆本科当兵的待遇相对较为优厚，具体包括以下几个方面：

工资待遇

义务兵：第一年每月津贴700元，第二年每月津贴820元。退役后复员费约为4万元，下士复原费约为20万元，一级上士复员费约为90万元。

士官：下士月工资约为4500元左右，中士约为5400元左右，上士约为6400元左右，四级军士长约为7400元左右。士官退役后复员费、复原费等具体数额依据服役年限和军衔等级而定，南疆地区可能更高。

军官：基层连职军官月工资平均在12000元左右。

新疆武警：工资水平在4000-5000元之间，但具体数额需根据实际情况而定。

一次性奖励金

对从本省应征入伍的大学生，按照本科毕业生每人不低于7000元、专科毕业生每人不低于6000元、在校生每人不低于5000元、高校新生每人不低于4000元的标准发放一次性奖励金。

经济补助

自主就业的退役士兵，由部队发给一次性退役金，自主就业的退役士兵每服役按3600元/年的基本标准发给一次性经济补助。

学费补偿

大学生士兵享受学费补偿，本专科每年不高于8000元，研究生不高于12000元。

家庭优待金

家庭优待金标准为每户每年12000元-15000元，农村籍义务兵每户每年4500-6000元。到艰苦地区服役的义务兵家庭由当地县市区政府给予一次性奖励10000元。

其他福利

除了工资外，还享有伙食补贴、住房补贴、医疗补贴等福利待遇。

服役期间还享有保留入学资格、享受国家资助学费、享受国家津贴、家庭享受军属待遇、免修军事技能分、升学优惠加分、优先提干、保送入学、享受研究生专项计划等优惠政策。

综上所述，新疆本科当兵的待遇较为优厚，涵盖了工资、一次性奖励金、经济补助、学费补偿、家庭优待金和其他福利等多个方面。具体待遇水平因兵种、军衔等级、服役地点等因素而异。建议有意向参军入伍的大学生详细了解相关政策，并根据自身情况做出选择。