牡丹江大学设有多个学院，提供多种专业，以下是一些主要的学院和专业：

智能制造学院

建筑工程学院

食药（医护）学院

信息与电气工程学院

财会与金融学院

经贸与管理学院

动画学院

传媒与艺术学院

外语学院

动画制作中心

附属中专

继续教育学院

社会科学部

体育教育部

具体专业设置包括：

生物制药与食品工程学院：

食品药品监督管理、工业分析与检验、食品加工技术、生物制药技术

信息与电气工程学院：计算机网络技术（信息安全方向）、光伏材料加工与应用技术、光伏发电技术及应用、电厂设备运行与维护（电气工程及其自动化方向）、物联网应用技术、移动通信技术（4G方向）

经贸与管理学院：旅游管理（航空服务方向）、营销与策划（订单培养）、旅游管理、市场营销、连锁经营管理、国际经济与贸易

传媒与艺术学院：美术教育、音乐表演、音乐教育、汉语（速录方向）、影视多媒体技术专业（电视栏目包装方向）、影视多媒体技术专业（影视化妆与美容方向）

财会与金融学院：金融管理与实务、会计电算化、会计与审计

机械工程系：机械设计及制造（逆向设计方向）、生产过程自动化、检测技术及应用（高铁方向）、机电设备维修与管理、机械设计及制造（石油钻采装备方向）、焊接技术及自动化（订单培养）

土木工程学院：道路桥梁工程技术、工程监理、建筑工程技术（订单培养）、工程造价、房地产经营与估价（订单培养）

动画学院：影视动画

外语学院：应用日语等专业

教育学院：学前教育、教育技术学相关专业

体育教育部：体育教育相关专业

请注意，专业设置可能会随时间变动，建议以牡丹江大学官网公布的数据为准。