政府合同合法性审查主要包括以下五个方面的内容：

合同主体：

审查合同主体是否合法，包括签订合同的当事人是否是经过有关部门批准成立的法人、个体工商户，是否是具备与签订合同相应的民事权利能力和民事行为能力的公民。同时，还需要审查法定代表人或主管负责人的资格证明，以及代订合同的，是否具备委托人的授权委托证明，并审查是否在授权范围、授权期限内签订合同。有担保人的合同，还需要审查担保人是否具有担保能力和担保资格。

合同形式：

审查合同的形式是否合法，包括合同是否需要经过有关机关批准或登记，如需经批准或登记，是否履行了批准或登记手续。如果合同中约定须经公证后合同方能生效，还应审核合同是否经过公证机关公证。如果合同附有生效期限，还应审核期限是否届至。

合同内容：

审查合同内容是否合法，包括合同内容是否损害国家、集体或第三人的利益，是否有以合法形式掩盖非法目的的情形，是否损害社会公共利益，是否违反法律、行政法规的强制性规定。同时，还需要审查合同条款是否完备，各条款内容是否具体、明确、切实可行，避免因合同条款不全和过于简单、抽象、原则，给履行带来困难，为以后发生纠纷埋下隐患。

订立程序：

审查合同订立程序是否合法，包括合同签订是否符合法定程序，是否有违反《合同法》相关规定等。市政府法制机构、部门法制机构或承担法制工作的机构还应当对合同条款是否完整进行审查，必要时可以对合同内容的合理性提出意见，但不对政府合同涉及的技术、金额等问题进行审查。

合同意思表示的真实性：

审查合同意思表示是否真实，确保合同是在双方完全平等、自愿的前提下签订的，没有损害第三者或社会公共利益的行为。

综上所述，政府合同合法性审查是一个全面、细致的过程，涉及合同主体、形式、内容、订立程序以及意思表示的真实性等多个方面，以确保合同的合法性和有效性。