深圳自考档案的存档方式有以下几种，具体选择哪种方式取决于个人的实际情况：

有工作单位的考生

将档案送到单位的人事管理部门，由相关工作人员帮助将自考档案存入个人档案中。这种方式最为方便，不需要额外跑其他地方。

无工作单位的考生

暂存学校：自考档案可以暂时存放在学校，但一般学校只能代为保管两年，之后需要转移到其他存放地点。

留学服务中心或人事代理机构：计划留学的考生可以将档案存放在这些机构，它们会妥善保管并在需要时提供服务。

基层就业：准备到基层工作的考生，档案可以转移到就业所在地的县级政府人社部门，他们会负责档案管理。

人才中心：无工作单位或单位无法存档的考生，应将自考档案与前置档案合并后存入户籍地或工作地的人才中心。在存档时，需准备好相关材料，如毕业证书、学位证书、成绩单等，并按照存档要求填写申请表。若档案袋未密封或已损坏，需联系自考办或主考院校重新密封盖章。

特殊情况

合并前置学历封档：自考档案应与之前前置学历档案（如高中或专科）合并。如果之前档案在人才中心，将自考档案送至同一地点合并。

密封《广东省高等教育自学考试毕业生登记表袋》：携带身份证原件前往本人《广东省高等教育自学考试毕业生登记表》上“地号”所在城市自考办密封《广东省高等教育自学考试毕业生登记表袋》。

建议

提前咨询：在存档前，建议先咨询当地的人才中心或相关机构，了解具体的存档流程和要求，以确保档案能够顺利存放。

准备材料：确保所有相关材料（如毕业证书、学位证书、成绩单等）齐全且真实有效，并按照存档要求填写申请表。

保持档案密封：在存档过程中，务必保持档案的密封性，不得擅自拆封，以确保档案的安全性和完整性。

通过以上步骤，你可以根据自己的实际情况选择合适的存档方式，确保自考档案得到妥善保管。