民办本科考研率低的原因是多方面的，主要包括以下几点：

保研率较低：

民办大学的保研率通常较低，与985和211高校相比差距较大。985和211高校的保研率通常在10%以上，甚至接近50%。

学习能力和知识结构有缺陷：

通过高考进入民办大学的学生在学习能力、整体素养和知识结构方面与公办学校或层次更好的学生相比存在较大差距。这导致他们在考研准备过程中可能会遇到更多的困难。

学术资源和科研平台不足：

民办大学在学术资源和科研平台方面通常不如985和211高校，这使得学生在科研能力方面较为薄弱，不利于考研。

学习环境和氛围不佳：

民办高校的学习环境和氛围与985和211高校相比存在较大差距。民办高校的学生可能缺乏学习动力和自律性，难以形成良好的学习习惯和氛围。

考研门槛和歧视：

部分985和211高校在招收研究生时对考生的本科教育经历有门槛，对民办大学或一般二本的学生存在一定程度的排斥。在分数相近的情况下，这些高校可能会优先选择较好大学的学生。

竞争激烈：

由于民办高校学生基数大，考研竞争非常激烈。在众多考研人中，民办高校的学生需要付出更多的努力和时间才能获得相同的机会。

第一学历歧视：

即使民办本科的同学考研上岸，也无法避免“第一学历”的企业歧视。这也是许多民办本科学生选择不考研的一个重要原因。

综上所述，民办本科考研率低的原因是多方面的，包括保研率低、学习能力和知识结构有缺陷、学术资源和科研平台不足、学习环境和氛围不佳、考研门槛和歧视以及竞争激烈等。因此，民办本科的学生在考虑是否考研时，需要综合考虑这些因素，并制定合理的职业规划。