对于上海自考毕业生的档案存放，有以下几种建议：

工作单位

如果自考生有工作单位，并且单位具有人事管理权（如国企、事业单位、政府部门），可以将自考档案与个人档案合并后存放在单位。

人才市场

对于没有工作单位或单位无人事管理权的自考生，可以将档案存放在当地的人才交流中心或社会保障局。人才市场通常不接受个人档案存放，需要单位审核担保后才能存放。

户籍所在地人力资源公共服务机构

如果既无工作单位，也无法通过单位存放档案，可以办理个人委托存档。

合并存放

自考档案最好与全日制统招学历档案合并存放，以保持档案的完整性和法律效力。

学校

对于在校学生，自考档案可以暂时存放在学校，但学校通常只能代为保管两年。

留学服务中心或人事代理机构

计划留学的考生可以将档案存放在这些机构，以便在需要时提供服务。

基层就业地点

准备到基层工作的考生，可以将档案转移到就业所在地的县级政府人社部门。

主考学校继续教育学院

自考档案也可以交给主考学校的自考办进行存档。

教育局

自考档案有时也可以存放在户籍所在地或工作所在地的教育局。

建议

有工作单位的考生，建议优先将档案存放在单位，这样既方便又符合相关规定。

无工作单位的考生，可以根据自己的实际情况选择存放在人才市场或户籍所在地的人力资源公共服务机构，并确保档案得到妥善保管。

无论选择哪种存放方式，都应确保档案的密封性和完整性，避免私自拆封或丢失。