土建工程师管理监理的方法如下：

明确监理职责

土建工程师作为建设一方的代表，应明确自己的职责和权力，包括对施工单位的管理和监督。

根据旁站管理规定及实施细则，安排旁站监理人员对关键部位和工序进行施工前24小时书面通知，并进行现场见证。

科学设置监理结构

重视监理机构的健全和监理结构的科学设置，推行“扁平化”的监理模式，精简监理层级，提高监理效率。

建立健全监理制度

关注施工阶段的各种不可控因素，尤其是对施工质量和安全产生关键影响的因素，通过建立健全的监理制度实现对工程的精细化监理。

提升监理人员素质

加强对监理人员的管理，包括加强监督与培训，提高监理人员的业务能力和职业素养。

监理资料管理

监理资料必须及时整理、真实完整、分类有序，并由总监理工程师负责指定专人具体实施。

理顺关系，正确行使监理功能

监理方与承包商的关系既是监理与被监理的关系，也是合作关系，监理工程师要使承包商理解和支持监理工作，执行监理发出的工作指令。

坚持原则，实事求是

监理工程师在监理工作中应强调各方利益的一致性和建设工程总目标，鼓励承包商汇报实施状况和遇到的困难，减少对抗和争执。

严格按规范、规程办理

监理工程师应严格按照国家和地方的施工及验收规范进行监理工作，确保工程质量。

定期汇报和请示

定期向总监理工程师及其代表报告土建专业监理工作的情况，对重大问题及时汇报和请示。

组织、指导、检查和监督

组织、指导、检查和监督土建专业监理员的工作，确保监理工作的顺利进行。

通过以上方法，土建工程师可以有效地管理监理工作，确保工程质量和进度，同时维护建设单位的利益。