物流公司做账的详细流程如下：

收入核算流程

收入确认：根据合同、运输单据和客户签收确认收入金额和时间。

收入登记：在会计系统中登记收入，并生成收入记录。

收入核对：核对系统中的收入数据与业务数据的一致性。

成本核算流程

成本分类：将成本分为运输成本、仓储成本、人力资源成本等。

成本计量：确定各项成本的计量方法，区分直接成本和间接成本。

成本分配：对共同成本进行合理分配，如按司机人数、里程数等分配。

费用核算流程

费用发生确认：根据票据和合同确认费用发生时间和金额。

费用登记：在会计系统中登记费用，并生成费用记录。

费用核对：核对系统中的费用数据与票据和合同的一致性。

资产负债核算流程

资产核算：定期盘点和确认公司资产，如货车、仓库、设备等，并反映在资产负债表中。

负债核算：根据实际情况确认和登记负债，如应付账款、短期借款等，并反映在资产负债表中。

会计账务处理流程

审核原始凭证：审核无误后编制记账凭证。

登记明细账：根据记账凭证登记明细分类账。

月末处理：计提、摊销、结转记账凭证，编制汇总表并登记总账。

结账对账：确保账证、账账、账实相符。

编制报表：编制准确完整的会计报表，并进行分析说明。

记账凭证装订：将记账凭证装订成册妥善保管。

纳税申报

根据不同的税务政策，合理计算增值税（VAT）、城市维护建设税、印花税等税种，并按时申报。

具体会计分录示例：

收到运输费用时：

借： 库存现金、银行存款、应收账款

贷： 主营业收入

支付运输费时：

借： 营业费用-运杂费（燃料费）

贷： 库存现金

计提各项税费：

借： 营业税金及附加-营业税、城建税、教育费附加、地方教育费附加

借： 管理费用-印花税

借： 所得税费用-所得税

贷： 应缴税费

包车费用：

与提供物流劳务服务有关：

借： 主营业务成本

贷： 库存现金或银行存款

与提供物流劳务服务无关：

借： 管理费用--交通费

贷： 库存现金或银行存款

以上是物流公司做账的基本流程和会计分录示例，具体操作时还需根据实际业务情况和当地税务政策进行调整。