截至2025年，经教育部批准设置研究生院的大学共有 59所。这些高校包括：

1. 北京大学研究生院

2. 中国人民大学研究生院

3. 清华大学研究生院

4. 北京航空航天大学研究生院

5. 北京理工大学研究生院

6. 北京科技大学研究生院

7. 北京交通大学研究生院

8. 北京邮电大学研究生院

9. 北京林业大学研究生院

10. 北京协和医学院研究生院

11. 北京师范大学研究生院

12. 南开大学研究生院

13. 天津大学研究生院

14. 中山大学研究生院

15. 同济大学研究生院

16. 浙江大学研究生院

17. 复旦大学研究生院

18. 上海交通大学研究生院

19. 南京大学研究生院

20. 武汉大学研究生院

21. 四川大学研究生院

22. 西安交通大学研究生院

23. 哈尔滨工业大学研究生院

24. 西北工业大学研究生院

25. 东南大学研究生院

26. 华中科技大学研究生院

27. 华中师范大学研究生院

28. 南京航空航天大学研究生院

29. 第二军医大学研究生院

30. 第四军医大学研究生院

31. 中国矿业大学研究生院

32. 中国地质大学（北京）研究生院

33. 中国石油大学（北京）研究生院

34. 华东理工大学研究生院

35. 江南大学研究生院

36. 南京工业大学研究生院

37. 中南林业科技大学研究生院

38. 河南大学研究生院

39. 华侨大学研究生院

40. 北京工业大学研究生院

41. 南京林业大学研究生院

42. 燕山大学研究生院

43. 山西大学研究生院

44. 郑州大学研究生院

45. 西北大学研究生院

46. 西安理工大学研究生院

47. 西安科技大学研究生院

48. 华中师范大学研究生院

49. 南京师范大学研究生院

50. 长安大学研究生院

51. 陕西师范大学研究生院

52. 昆明理工大学研究生院

53. 杭州电子科技大学研究生院

54. 山西大学研究生院

55. 黑龙江大学研究生院

56. 东北林业大学研究生院

57. 成都理工大学研究生院

此外，还有部分高校在2011年之后自行设立了研究生院，并报国务院学位委员会备案，这些高校的数量超过70所。

建议在选择大学时，可以优先考虑这些经教育部批准设置研究生院的59所高校，因为它们在研究生教育方面具有较高的教学水平和研究实力。