南京的好大学主要有以下几所：

南京大学

南京大学是中华人民共和国教育部直属的综合性全国重点大学，位列国家“双一流”世界一流大学建设高校A类、“211工程”、“985工程”重点建设高校。学校以自然科学和工程技术学科为主，拥有众多国家级重点学科和实验室。

东南大学

东南大学是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，是国家“双一流”世界一流大学建设高校A类、“211工程”、“985工程”重点建设高校之一。学校以工、理、文、管、医等多学科协调发展，尤以工科和医学见长。

南京理工大学

南京理工大学是隶属于中华人民共和国工业和信息化部的全国重点大学，是国家“双一流”世界一流学科建设高校、“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校。学校以工为主，理、工、文、经、管、法等多学科协调发展。

南京航空航天大学

南京航空航天大学是中华人民共和国工业和信息化部直属的一所具有航空航天民航特色、以理工类为主的综合性全国重点大学，是国家“双一流”世界一流学科建设高校、“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校。

南京师范大学

南京师范大学是中华人民共和国教育部与江苏省人民政府共建的综合性全国重点大学，是国家“双一流”世界一流学科建设高校、“211工程”重点建设高校。学校以师范教育为特色，文、史、哲、理、工、教等多学科协调发展。

南京农业大学

南京农业大学是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，是国家“双一流”世界一流学科建设高校、“211工程”重点建设高校。学校以农科为特色，农、理、经、管、文、法等多学科协调发展。

南京医科大学

南京医科大学是中华人民共和国教育部、中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会、江苏省人民政府共建的省属重点大学，是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校以医学为主体，医、理、管、文、法等多学科协调发展。

南京邮电大学

南京邮电大学是中华人民共和国教育部与江苏省人民政府共建的省属重点大学，是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校以信息学科为特色，工、理、管、文、教等多学科协调发展。

南京工业大学

南京工业大学是中华人民共和国教育部与江苏省人民政府共建的省属重点大学，是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校以工为主，理、工、文、经、管、法等多学科协调发展。

南京信息工程大学

南京信息工程大学是中华人民共和国教育部、中国气象局、江苏省人民政府共建的省属重点大学，是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。学校以大气科学为特色，理、工、文、经、管、法等多学科协调发展。