中国人民解放军第三军医大学（现更名为中国人民解放军陆军军医大学）的系部设置如下：

一、主要系部构成

基础部

负责基础医学教学与科研工作，是医学教育的核心部门。

公共卫生与军事预防医学院

专注于疾病预防、健康促进及军事医学相关领域的研究与教学。

药学院

从事药物研发、药理学及临床药学研究。

生物医学工程学院

覆盖生物医学工程、医疗器械、生物技术等方向。

医学心理系

研究医学心理学及心理健康教育。

高原军事医学系

专注于高原环境下的医学问题研究与防治。

医学检验系

负责临床检验、病理诊断等技术支持。

医学影像系

从事医学影像学、放射技术等领域的教学与研究。

护理系

培养护理专业人才，涵盖临床护理、护理管理等内容。

二、其他重要机构

研究生院 ：负责研究生培养与科研管理。

外训大队/士官学校 ：承担军事技能培训任务。

附属医院 ：包括西南医院（含陆军第九五八医院）、新桥医院（含陆军第九五三医院）等，提供临床教学与实践平台。

三、学科优势与特色

学校占地面积6210.15亩，建筑面积194万平方米，仪器设备总值50.21亿元，拥有西南医院、新桥医院等多所国家级医院作为教学基地。其前身可追溯至1929年南京中央医院，具有深厚的医学积淀和临床教学经验。

注：部分系部如“医学心理系”在部分资料中未单独列出，可能归入“基础部”或“公共卫生与军事预防医学院”下属机构。建议通过官网进一步确认具体设置。