在深圳可以参加自学考试（自考）的院校主要包括以下几类，综合多来源信息整理如下：

一、主考院校

暨南大学

作为深圳重点建设高校，提供多学科本科及专科自考专业，如会计学、工商管理等。

深圳大学

综合性大学，涵盖文、理、工、经、管等多领域专业，是深圳本地主流自考院校。

华南师范大学

国家重点建设高校，自考专业包括工商管理、教育学、英语等，教育资源丰富。

华南理工大学

工科特色鲜明，提供计算机科学与技术、金融学、土木工程等专业自考。

广东外语外贸大学

以商科见长，英语、商务英语、国际经济与贸易等专业为特色。

广东财经大学

经济管理类为主，会计学、金融学、工商管理等专业较热门。

南方医科大学

医学类为主，护理学、临床医学等专业在自考中占有一定比例。

广东工业大学

工科与商科结合，机械设计制造及其自动化、工商管理等专业较受欢迎。

惠州学院

覆盖经、管、工、文等多领域，会计学、电子商务等专业有自考课程。

广东技术师范大学

职业教育特色突出，计算机应用技术、会计实务等专业适合技能型考生。

二、其他相关说明

主考与辅考区别 ：主考院校是自考课程的主办单位，负责组织考试；辅考院校可能提供教材、辅导等支持，但考试由主考院校命题。

选择建议 ：建议根据个人职业规划、兴趣及专业需求选择院校，可优先考虑深圳本地高校（如深圳大学）的实时招生简章。

注意事项 ：部分院校可能对报考条件、课程替换规则有具体要求，需以当年官方发布的招生文件为准。

以上信息综合了多篇权威来源，考生可根据实际情况进一步确认具体专业设置及报名流程。