在新疆的二本理科大学中，以下专业被认为是热门且具有较好的发展前景：

计算机类专业 ：

计算机科学与技术 ：涵盖基础学科的计算机科学与技术，以及以软件为主的软件工程等专业。计算机类专业在各行各业都备受青睐，无论是软件开发还是信息管理，都离不开计算机技术，而且国内对信息技术人才的需求量极大。

软件工程 ：作为计算机类专业的一部分，软件工程专注于软件的开发、设计、测试和维护。

电子信息类专业 ：

电子信息工程 ：侧重于电子和信息领域，随着互联网的普及、大数据的兴起以及人工智能的崛起，电子信息类产品在市场上广受欢迎，相关人才也较为稀缺。

通信工程 ：涉及通信网络的构建和维护，是信息技术领域的重要组成部分。

医学类专业 ：

预防医学 ：国家级特色专业，学校的优势和特色专业。

药学 ：国家级特色专业。

临床医学 ：在第四轮学科评估中被评为C+，进入ESI全球排名前2.88‰。

维医学 和 中医学 ：国家级特色专业。

环境工程专业 ：

虽然环境工程专业比较偏向于理论型，就业需要比较高的学历，但掌握了技能知识的话，就业还是不算太难。这个专业对毕业院校也比较重视，但本科就业的收入不高。

生物科学专业 ：

生物科学专业对学历要求很高，就业率本身不高，需求量低。因此，二本考生报考这个专业需要慎重。

基础理学类专业 ：

包括数学、物理学、化学等基础理学专业，这类专业就业面很窄，大部分出来都是做老师或者在各类型事业单位工作。但同时，老师和事业单位的就业竞争又是非常大的。

法学专业 ：

法学专业报考热度逐年攀登，许多同学对法学专业有一定的了解，并且有很多电视剧都有法学专业相关情节。

土木工程与自动化 ：

新疆农业大学和塔里木大学都开设了这个专业，被认为是二本中较好的专业之一。

应用化学专业 ：

塔里木大学热情欢迎的专业。

财经类专业 ：

新疆财经大学等学校开设的财经类专业，如金融学、会计学等，也是较为热门的专业。

这些专业在新疆的二本理科大学中具有较高的热门度和较好的发展前景。建议在选择大学和专业时，综合考虑学校的教学质量、专业设置、地理位置以及个人兴趣和职业规划。