复旦大学有多个优秀的学科和系，每个系都有其独特的优势和特点。以下是一些被广泛认为最好的系：

经济学 ：复旦大学经济学系在国内外都享有很高的声誉，多次被评为全国经济学一流学科。

法学 ：复旦大学法学院是中国法学学科建设的重要基地，曾获得教育部法学学科评估A+等级。

国际关系 ：复旦大学国际关系与公共事务学院是中国国际关系领域的重要学术基地之一，被认为是中国国际关系教育、研究的重要窗口。

信息科学与技术 ：复旦大学计算机科学技术学院是中国计算机科学技术领域的重要学术基地之一，拥有强大的科研团队和教学资源。

数学与应用数学 ：复旦大学数学系在全国具有领先地位，是该校的王牌专业之一。

新闻传播学 ：复旦大学新闻学院历史悠久，在国内享有很高的声誉，是新闻传播学领域的强校。

临床医学 ：复旦大学临床医学学科在国内属于顶尖水平，多个学科被评为国家重点学科。

电子工程系 ：电子工程系始建于1960年，重建于1982年，设有电子信息科学与技术本科专业，电路与系统学科为国家重点学科。

光科学与工程系 ：光科学与工程系成立于2000年，学科发展紧跟国际科学前沿，开展有多个研究方向。

光源与照明工程系 ：复旦大学光源与照明工程系暨电光源研究所被公认为我国光源与照明领域的权威研究单位之一。

通信科学与工程系 ：通信科学与工程系始建于。

建议

选择哪个系最好，取决于个人的兴趣和职业规划。如果对经济、法律、国际关系、计算机科学等领域感兴趣，这些系都是非常好的选择。如果对电子工程、光科学、光源与照明、通信科学等工程技术领域有兴趣，这些系也非常值得考虑。建议结合自己的兴趣和职业规划，详细了解各个系的具体情况，包括课程设置、师资力量、科研方向等，以便做出最适合自己的选择。