郑州大学拥有众多科研机构，涵盖了不同的学科领域。以下是一些主要的科研机构：

国家级科研机构

食管癌防治国家重点实验室（省部共建）

国家橡塑模具工程研究中心

国家钙镁磷复合肥技术研究推广中心

国家药品临床研究基地

细胞与基因治疗国际研究中心

化工安全工程技术研究中心

碳环保材料智能设计国际联合研究中心

癌症化学预防国际联合研究中心

国家药物安全性评价研究中心

教育部重点实验室

材料物理教育部重点实验室

材料成形过程与模具教育部重点实验室

河南省激光与光电信息技术重点实验室

河南省肿瘤病理重点实验室

省级重点实验室（工程中心）

河南省实验动物中心

河南省道路检测工程技术研究中心

河南省电磁检测工程技术研究中心

河南省肿瘤重大疾病靶向治疗与诊断重点实验室

省部共建人文社科重点研究基地

郑州大学公民教育研究中心

郑州大学中原网络安全研究院

郑州大学大别山学院

汉字文明传承传播与教育研究中心

河南省社会科学研究基地

河南省高校人文社会科学重点研究基地

其他研究机构

郑州大学农学院

生物多样性与生态学研究所

吞咽障碍研究所临床科研基地

河南先进技术研究院

医药科学研究院

郑州大学环境科学研究院

郑州大学医学实验中心

中原关键金属实验室

郑州研究院

这些科研机构涵盖了科技、医学、人文社科等多个领域，为郑州大学的研究工作提供了坚实的基础，并促进了学校在各个学科领域的发展。